公元893年，秋，八月，朱温下令庞师古移兵去攻击兗州。朱瑾屡战屡败，只好退保兗州。十二月，朱温又派大将葛从周带兵去攻打齐州（即今山东省济南市），齐州守将刺史朱威派人飞马向朱瑄、朱瑾求救兵。朱瑄、朱瑾只好带兵去救齐州。
朱温发兵与兗、郓军激战，这时李克用也没闲着。李克用发兵去打邢州，决心要处理李存孝这个逆子。王镕挨打的时候，李存孝帮助过他，这次该他帮助李存孝了，王镕发兵去救邢州。在平山（今属河北石家庄）王镕遇到了李克用的军队，被李克用的鸭儿军杀得大败。李克用改攻镇州，这下王镕害怕了，向李克用举手投降，并答应李克用助其粮草，发兵三万同李克用一起去打李存孝。李克用亲自带兵屯驻栾城，王镕驻任县，李存信驻琉璃陂，采取对李存孝包围之势。
李存孝最恨的就是李存信，他首先出兵去夜袭李存信的大营。奉城军使孙考老遇到了李存孝，不过三合被李存孝打下马来活擒，李存信先吃了一次败仗。李克用亲率大军进抵邢州城下，在邢州城外挖堑壕，筑堡垒围困李存孝。起初李存孝经常带兵出城突袭，河东兵堑壕总是挖不成。后来有个河东牙将袁奉涛秘密派人对李存孝说：“大王（指李克用）等到堑壕挖成就要回晋阳去了，尚书（指李存孝）怕的就是大王，其余诸将都不是尚书对手。几尺宽的堑壕怎能挡住你的进攻呢？”李存孝听信了袁奉涛的话，不再出兵冲击挖堑壕的士兵。不过几日，堑壕和堡垒筑成了，李存孝再出城被堑壕和堡垒所挡，已经无法越过堑壕与河东兵交战了，只好困守孤城。
李茂贞打败了杨守忠和杨复恭，开始不再把昭宗放在眼里，多次上表，对朝廷语多不逊。昭宗决定要讨伐李茂贞，宰相杜让能劝道：“陛下初登大宝，国步维艰。李茂贞近在国门，臣以为不可与其构怨。”李晔不听，他说：“朕不甘心做孱弱之主，低声下气的过日子，任人*。你只要为我搞好供应，我派诸王去打李茂贞。”
公元983年，九月，昭宗李晔派覃王嗣周带领三万人马送新任凤翔节度使徐彦若去赴任，驻军在兴平。李茂贞与王行瑜带六万兵来到盩厔抵挡*。李茂贞向兴平发起进攻，*都是新招募的市井少年，而李茂贞的军队都是训练有素身经百战的士兵，结果可想而知，战斗一开始*就作鸟兽散，大败溃逃。李茂贞等乘胜进攻三桥，京师震恐。朝中另一位宰相崔昭纬与杜让能争权，暗中通报李茂贞，说：“用兵都是杜太尉出的主意。”李茂贞于是上书要求杀掉杜让能。
昭宗只好罢免了杜让能的宰相职位，把他流放到梧州作刺史，和杜让能同时被贬的还有观军容使西门君遂、内枢密使李周潼、段詡等人。李茂贞坚持要杀杜让能，最后昭宗李晔没有办法，只好杀了西门君遂、李周潼、段詡，赐死杜让能，而且任命李茂贞为凤翔节度使和山南西道节度使、守中书令，至此李茂贞有了凤翔、兴元、洋、陇秦十五州之地。
公元894年，春，正月，昭宗李晔又宣布改元，将景福年号改为乾宁，大赦天下。李茂贞带兵入朝，不久回归本镇。
二月，朱温带兵驻扎在渔山，朱瑄、朱瑾合兵来攻渔山，双方在渔山脚下大战一场。战斗开始刮的是东南风，兗、郓军占上风，节节进逼，汴军只好后退。不久老天爷变了脸，又刮起了西北风，这次朱温没有放过机会，他命汴军顺风放火，兗、郓军被烧得大败，损失了一万多人马。
李克用督军攻打邢州，李存孝被困在邢州。三月，城内军粮草料都用尽，李存孝虽然武勇，但到此时也没了办法。李存孝登上城楼，求见李克用，他对李克用说：“儿蒙父王的大恩，才得以富贵。若不是李存信谗言害我，我怎肯背叛父王。现在我只求见父王一面，与父王讲一句话，死也甘心。”李克用请出刘氏夫人进城劝李存孝归降，刘氏夫人向来待李存孝犹如亲生，存孝感刘氏夫人之恩，随刘氏夫人出城来见李克用。
李存孝跪在李克用马前领罪，说道：“儿立有功劳，李存信谗言逼我，才使我走错这一步。”李克用大声苛斥道：“你給朱温和王镕写信，百般诬蔑我，也是存信教你的吗？”于是命人用铁链绑了李存孝，押回晋阳，五马分尸杀了李存孝。
李存孝是五代史最猛的勇将，他本是代州灵丘突厥族沙陀部落人，本姓安，名敬思。武艺过人，作战勇猛，被李克用收为义子，称为第十三太保。李存孝跟随李克用南征北战屡立战功，李克用要杀李存孝本以为会有人为他求情，没想到由于其他诸将嫉妒他的军功，竟无人为他求情，李克用只好含泪将李存孝五马分尸。又有河东军另一猛将，名薛阿檀者，因暗通李存孝，李存孝被捉，他怕事情泄露，自杀而死。
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