黄巢又派朱温把守东渭桥，和朱温隔河相对的是鄜延节度使李孝昌和权夏绥节度使拓跋思恭。两军交战互有胜负，黄巢派尚让带兵援助朱温。在尚让的监督下，朱温只好卖卖力气，督军猛攻*营寨。李孝昌、拓跋思恭支持不住，只好向其它诸镇兵求援。但官军此时缺乏统一指挥，援军迟迟不到，李孝昌、拓跋思恭只好败退到富平。
公元881年十一月份，黄巢命令尚让回京，派孟楷来朱温部队监军。朱温、孟楷带兵攻击退到富平的鄜、夏联军，李孝昌、拓跋思恭被杀得大败，只好退回老巢，鄜州和夏州。朱温和孟楷虽然打了胜仗，但朱温对孟楷可不像对尚让那样尊敬。朱温每次战斗都是独断专行，不听孟楷的建议，两人意见相左，矛盾渐深。
黄巢复夺长安后打了几个胜仗，派去攻打华州的李祥也击败了王重荣手下的大将高浔，重新夺回了华州。到公元881年底，大齐皇帝黄巢逐渐稳住了局势。而*方面由于缺乏统一指挥，各藩镇统领又拥兵自重保存实力，甚至为争地盘而内讧，因此对义军的攻击也减弱了不少。
沙陀军统领李克用，传檄河东各部，集合了五万兵马入京勤王，被河东节度使，太原尹郑从谠挡在了太原城下。李克用拍马到城下要求郑从谠拨付一些军粮给养，郑从谠怕李克用趁机取他城池，坚决不许李克用军马进城，只给了他钱几千缗，粮几千斛。李克用那看得上这点钱粮，大怒，纵兵大掠。郑从谠大惊，求救于振武节度使契苾璋，契苾璋带突厥和图谷浑兵来救太原，结果也不是李克用对手，被追进晋阳城。沙陀兵劫掠阳曲、榆次而回，攻取了忻州和代州，作为立足之地。
公元881年十月，还发生了一件不利于大唐官军的事，这就是凤翔行军司马李昌言逼走了*前线总指挥郑畋。凤翔城内粮饷不继，因此不能足额供应前线粮草。李昌言由驻守的兴平出发，鼓动士兵去攻击府城凤翔。郑畋登城对兵士们说：“如果行军司马能够爱护士兵，为国灭贼，我愿意交出兵权。”第二天郑畋就把所有事务交与李昌言，就西去蜀中见僖宗皇帝去了。郑畋至凤州（陕西凤县），上表要辞去统兵官职位，僖宗皇帝封了他一个太子少博的职位。而任命李昌言为凤翔节度行营招讨使。
僖宗中和二年（公元882年），新年刚过，大齐皇帝黄巢任命朱温为同州（今陕西渭南市）刺使。当时同州并不在大齐军手中，朱温必须先攻下同州才能成为名副其实的同州刺使。
二月份朱温带领所部兵马由丹州（今陕西宜川县）南下，攻进同州治所左冯翊（今陕西大荔县）从而占领了同州全境。同州原刺史是王重荣的部下米诚，他打不过朱温，只好弃城逃到河中仍去投奔王重荣。
朱温占据了同州，有了自己的一块地盘，上马管军，下马管民，犹如二号皇上，自是与在长安不一样。
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