亚历山大前进的下一个方向是波斯帝国的最后一个首都哈马丹，这是米底人的都城。高加米拉一战大败后，大流士三世就随他的堂兄巴克特里亚王子帕萨斯逃到这里。随他而来到这里的只有不足万名士兵。当他听说亚历山大正率大军向哈马丹进军时，急忙命军队赶快启程，向帕萨斯的老巢巴克特里亚逃跑。
公元前330年3月末，亚历山大率马其顿大军从波斯波利斯出发，向大流士三世所在地米底亚的哈马丹进军。沿途并未遇到波斯军队的抵抗，经过12天的急行军，才遇到一小股波斯军队，经过短暂的交锋，这小股军队很快被打败。从抓获的俘虏口中得知，大流士三世已于5天前从哈马丹向北朝巴克特里亚方向逃窜。亚历山大命令部队继续前进，攻克哈马丹。这样，波斯帝国的四个都城已全部被亚历山大占领，波斯帝国这一世界上第一超级帝国最后灭亡的日子已指日可待了。
占领哈马丹后，亚历山大并未急于去追赶大流士三世。经过十几天的急行军，部队已经非常疲乏，他要对军队进行休整和整顿。他解散了主要由色萨利骑兵组成的希腊城邦的盟军，给他们发了薪饷并犒赏一份贵重礼物，让他们乘船回家。亚历山大命哈帕鲁斯率领6 000名马其顿士兵驻守哈马丹，命帕米尼欧率一部分军队由一条比较艰险但却比较捷径的道路追击大流士三世，自己则率其余军队由大路追击大流士三世。
在送走亚历山大所率部队后，帕米尼欧却没有按亚历山大的命令去追击大流士三世，因为他已经60多岁，征战了几十年，实在是厌倦了战争。况且哈马丹还有这么多美女让他享受。
由于消灭大流士三世心切，亚历山大命军队全速推进，用了11天时间追到距哈马丹320千米之遥的拉格伊（在现德黑兰附近）。到达此后，稍做休息，第二日又急行军80千米，抵达帕提亚沙漠边缘的里海关口。但他们还是来晚一步，大流士三世已经过了关口。见前面已是沙漠地带，部队缺粮缺水，亚历山大不敢贸然挺进，他命令部队在此休整，派科纳斯率领小分队到附近收集粮草和饮用水。这一带是波斯帝国的帕提亚行省，相当于今伊朗的呼罗珊省。这里山地贫瘠，居民以一些带壳的果实为主食，用栗子制作面包，用植物根茎酿酒，以狩猎和抢劫为副业。马其顿军队在此寻找粮草和饮用水比较困难。
到了第5天时，从大流士三世处逃离一批人向亚历山大投降，其中包括波斯王族的巴基斯坦尼和巴比伦总督马扎亚斯的儿子按提贝拉斯。他们向亚历山大告之，帕萨斯等人已发动政变，将大流士三世囚禁起来。柏萨斯已经自立为波斯国王。听到这个消息，亚历山大认为不能让柏萨斯逃走，他亲自挑选500人的精兵队伍，只带够两天的给养，日夜兼程地追赶上去。
再说柏萨斯夺取了大流士三世的王位后，将这位前国王囚禁在一个笼子里随队向巴克特里亚方向行进。行进中，突然有士兵来报，一支军队正在朝他们的方向追来。柏萨斯命令骑兵部队断后抵抗，自己则带领其余部队押解着大流士三世的囚车前进。骑兵部队一见马其顿士兵冲将上来，未做抵抗便一哄而散。柏萨斯一见无法再押解大流士三世逃跑，便命人将其刺伤，自己带领其余人马向巴克特里亚方向逃去。亚历山大追击到大流士三世的囚车后，这位国王已被梭镖刺得伤痕累累，他看了亚历山大一眼，就气绝身亡了。
大流士三世的死亡，预示着由居鲁士大帝开创的，横跨亚非欧三大洲，历时200多年的波斯帝国的寿终正寝。也预示着人类历史上第二次世界战争达到了高潮，人类历史上第二个超级帝国马其顿帝国将要诞生58xs8.com