一晃几个月过去了，仍不见亚历山大前来决战的迹象，大流士三世不免有些心急，因为60万大军每天的粮草消耗是一个很大的数目。探马不断来报，亚历山大正率马其顿军队驻守在塔尔苏斯城，整天不是祭祀神灵，就是搞各种文艺和体育活动，完全没有把波斯帝国大流士三世国王率领的波斯大军放在眼里。经过与手下的将领商量，大流士三世决定率军与亚历山大进行决战，他命令随军辎重和金库转移到距离索契200英里的大马士革，亲率大军越过阿曼尼亚关口，向塔尔苏斯进攻。当他们到达塔尔苏斯时，攻进城里一看，马其顿大军已没了踪影，城中只剩下一些老弱伤兵。从俘虏的口中得知，亚历山大已率马其顿大军向索契进发。大流士三世命令杀掉所有的俘虏，然后率军向索契方向追击亚历山大而去。当追击到比拉鲁斯河时，大流士三世命令军队停止前进，在河边的伊苏斯城就地安营扎寨，等候马其顿人来战。
再说亚历山大在塔尔苏斯久留不见大流士三世来攻，便决定向波斯军队发起进攻。就在大流士三世率波斯大军翻越阿曼尼亚山口向塔尔苏斯进军时，亚历山大同时也率马其顿大军从另一隘口翻越阿马努斯山向索契进发。因为当时是夜晚，两军谁也没发现谁。当亚历山大接到探报说波斯大军已占领塔尔苏斯并且杀了留守城中的所有伤兵时，亚历山大愤怒了，他命令军队马上原路返回，他要为这些死难的伤兵报仇！双方在比拉鲁斯河隔河相遇，与上次马其顿军队与波斯军队隔河相对峙不同的是，这次马其顿军队在河的东部，而波斯军队在河的西部，这次统帅波斯大军的是波斯帝国的国王大流士三世率领的60万大军，而上次仅是波斯总督阿西提斯率领的2万人马。
波斯军队虽然号称60万大军，但其中成分却比较复杂，或许大流士三世根本就没把亚历山大率领的三四万马其顿军队放在眼里，他不但随军带着他的妻子女儿，还将他的年逾八旬的老母亲也带来了。
亚历山大命军队分为左、中、右三翼，左、右两翼是轻装步兵和骑兵，中央是方阵兵。左翼的指挥官是老将帕米尼欧和他的儿子菲洛塔斯，中央军团的方阵兵由托勒密指挥，亚历山大亲自指挥右翼军团，他要以此翼为突破口战胜波斯人。
和马其顿人相对应，波斯人也摆开阵势。30 000名希腊雇佣军位居中军前列，左、右两翼各有60 000重装步兵和骑兵，大流士三世也率他的卫队“万人不死军”坐镇中央，其余部队在其后分布。
比拉鲁斯河是条小河，河水较浅。首先由亚历山大率领马其顿军队的右翼向波斯军队的左翼发起了进攻。亚历山大命令弓箭部队向河对岸的波斯部队发射巨大的石弹和密集的箭支，波斯人猝不及防，被打得乱作一团。亚历山大见波斯军队阵容已乱，率右翼部队迅速向河对岸的波斯左翼部队杀去。很快波斯军队的左翼被打溃散。亚历山大率右翼部队又向位居波斯军中路的希腊雇佣军发起进攻。希腊雇佣军虽然拼死抵抗，但在强大的马其顿方阵军和骑兵的前后夹击下，很快就溃不成军，纷纷战死。这样大流士三世坐镇的中军就暴露在马其顿大军的眼下，亚历山大一马当先率领卫队冲向大流士三世。大流士三世的弟弟奥克撒拉斯人高马大，身着盔甲，手舞战斧，与亚历山大的卫队长赫斐斯申战到一块。激战正酣时，一枚流箭将奥克撒拉斯的坐骑射中，那马一声狂吼，后蹄一甩，冷不防将奥克撒拉斯摔下坐骑。赫斐斯申就势一剑将其刺死。大流士三世一看马其顿人冲了过来，便命马车夫掉头就跑，不料驾车马匹已受伤，他便弃车骑上一匹马狼狈逃窜。波斯军队的右翼方阵和骑兵在与帕米尼欧率领的马其顿左翼进行的战斗中已稍占上风，迫使马其顿军向河中后退。当一见另两翼已经战败时，这一翼也无心恋战，杀出一条血路追随大流士三世向后撤退。
此战因在伊苏斯城附近进行，后来被称为伊苏斯会战。此战是几百年来希腊世界的盟主与当时世界上最大的国家波斯帝国的国王亲自统帅的军队进行的第一次战斗，结果以波斯国王统帅的军队大败而结束。在此次会战中，波斯帝国战死士兵100 000人，而马其顿军队仅战死450人，4 500人受伤。波斯帝国的灭亡不可避免了。
大流士三世虽然逃跑了，但他的母亲、妻子和两个女儿却成了亚历山大的俘虏。亚历山大为了争取波斯人对他的支持，并未虐待她们，而是让她们保留皇家的地位和一切所拥有的财物。她们是亚历山大今后与大流士三世打交道的筹码。58xs8.com