为了保存这些黄册，明太祖朱元璋规定以“后湖”(即今天的南京玄武湖)各岛为库址，修建了我国古代最大的档案库――黄册库。随着黄册数量的逐年增多。黄册库也随之不断扩建，很快便布满了湖中五岛。据《后湖志》记载：洪武二十四年(公元1392年)，册库34间，册架135个；弘治五年(公元1492年)，册库337间，册架1334个；万历三十年(公元1602年)，册库667间，册架2660个。(摘自博采资源库)
为了黄册的安全，明朝统治者采取了很多保护措施。后湖被划为禁区，在湖的内外派有专门官吏和兵士负责守卫和巡逻。岛上立有朱元璋的刻石诏书，上有对后湖黄册库管理的各项要求，如：不许库外人员入库，过湖船只和库房钥匙均由南京大内太监掌管，开船开库均有定期，岛上库区严禁烟火，偷册者不分首犯协从均判斩刑等。在南京太平门和神策门外建有红碑亭各一座，亭内碑上刻有朱元璋的敕谕：禁止南京城内居民引用后湖的水，禁止农民耕种后湖周围的土地，禁止人们到湖中捕鱼和到湖附近放牧、打柴等。58xs8.com