在武昌驻守的太平军共有两万多名，拥有几千只船舰，并且还在武昌城外修筑了坚固的防御工程。但是这些船舰都是由民船改装而成，并不适合做战。而且武器装备简陋，用的都是土炮，也缺乏有经验的将领。再加上太平军已两次遭到惨败，信心极其不足。
而湘军的情况则恰好相反，总兵力在两万左右，武器装备也很精良。水师虽然在城陵矶惨败，但陆军却获大胜，并最终攻下了城陵矶。曾国藩此时也是信心十足，增加了水师的兵力，使船舰更加坚不可摧。
黄、石等人毫无指挥的才能，官兵也悲观失望，在太平军失陷花园、洪山的第二天夜里，便弃城逃走。长江上游最重要的重镇武昌，就这样轻易地丢给了湘军。汉水里的大批船只、数千水军及城里的守卫部队都没有得到撤退的消息。
湘军攻城时，城里的守将早已逃跑，守军大乱。湘军登上城墙，打开城门，一捅而入。凶猛的湘军逢人便杀，太平军尸横满街，血水成河。
水师乘机对未撤离的汉水太平军船队进行围攻，数千只船舰，有的被烧毁，有的被击沉，无一能够幸免于难。太平军水师受到毁灭性打击。
短短的几天时间，湘军中只有二百多人伤亡，却一举将武昌重镇攻下，使太平军损失了二千多艘船舰，数千名士兵。代价如此小，战绩却如此辉煌，实在出乎意料。如此大胜，使整个满汉统治阶级受到了极大地鼓舞。
咸丰收到捷报后，高兴得比曾国藩还要厉害。他简直不敢相信曾国藩一个文员，率领编练不足一年的湘军，竟把武昌攻克，收复两湖大部失地。看过奏报后，立即下旨，任命曾国藩为湖北巡抚。随后，又下旨封赏湘军其他将领。
正当大家兴高采烈，喜庆荣升之时，又一道上谕弄得众人晕头转向：收回曾国藩任湖北巡抚的旨意。
湘军立了这么大的功，而身为主帅的曾国藩的官职却半点未动，许多湘军将士都想不通。究其原因，咸丰帝是在遵奉大清祖训，即不肯把地方督抚大权交给手握兵权的汉人控制。
此后，曾国藩率军艰苦奋斗，仗越打越大，声名越来越高，清政府对他也越来越不放心。此后的若干年内，虽然授曾国藩以地方大员之位，但是还是不断发生改变，对他游移不定，甚至还加以打击，使曾国藩左右为难，进退维谷，非常尴尬。
不管怎么说，这次收复武昌的胜利，从武汉三镇掳掠了大量财物，许多湘军将领和士兵得以加官晋级，更以为太平军已是日薄西山，没有几天活儿头了。于是，他们便把从军作战当作风险小而又可以名利双收的捷径，所以以极大的热情投入到新的战役中，希望有更大的收获。
攻克城陵矶、夺取武昌以后，曾国藩在以后的日子里感到无限风光。自此以后，屡攻屡克、屡战屡胜的他大有一鼓作气将金陵拿下的攻势。58xs8.com