后来盘古族秉承着盘古的遗志继续制造天地，伏羲创造八卦，制定了各界的秩序，女娲创造出了人类，使大地有了勃勃的生机。而黄帝和蚩尤则分别创建了自己的部族，率领着手下神族为了争夺所谓的正统的盘古继承权整日里征战不休。
最后在人界的逐鹿，双方展开了最后的决战，蚩尤有罗喉辅佐，手下又有八十一个铜头铁额的兄弟和风伯雨师等大神，又有诸犍、诸怀、必方等神兽，虽然黄帝有炎帝、帝喾、颛顼辅佐，有风后、应龙等大神和麒麟、龙、凤等神兽相助，但是由于轩辕族本身上就没有九黎族善战，所以渐渐落于下风。被蚩尤用风伯雨师召唤出漫天大雾困住。
在黄帝即将败北之即，盘古族的九天玄女因为爱慕大神颛顼，违背了伏羲、女娲两不相帮的命令，偷偷带着自己带的兵书战策还有修炼的各种神兵利器前往相助黄帝一族，最终用指南车破了蚩尤的雾阵，又召唤来法力通天的吼，率领旱魃一族用本身的天性击败了风伯雨师。
而蚩尤的兄弟们本来可以抵挡刀斧的铜头铁额，却也抵挡不住九天玄女的九大神兵，至此，胜利的平衡逐渐倒向黄帝方面。
最后，无奈的罗喉只有用通天法力劈开巨大的时空裂缝，带着九黎族逃到了阴暗的幽明地界，而留下断后的蚩尤却被黄帝带领九天诸神团团围住。
蚩尤力战不屈，连杀超阶大神三人，高阶大神数百，中阶低阶大神无数，最后神力耗尽，被黄帝用五匹天马拉住四肢和头颅，要将蚩尤五马分尸。
蚩尤发出了令人心颤的怒吼，每一声吼叫，他都运力挣扎，将五匹天马拉的接连后退。最后黄帝用紫电神戟刺入蚩尤的心脏，将他钉在地上，然后又用宝剑斩下了蚩尤的头颅和四肢，然后用雷火神车将尸体分别拉向了天涯海角，而灵魂则被封印在飘泊在天地之间没有固定地点的须睨山上，并发出了“尔将永不能复合，永不能回来”的誓言。
从此天地归于黄帝统治，分封各界，为了避免再发生争斗，于是黄帝封闭了各界间的通道。其中人类作为潜力最大的种族被单独封在了人界。之后，四方大神各司其职，其中火神祝融与水神共工分掌水火，神力极大。后黄帝传天帝位于颛顼，自己闭关不再理事，颛顼接掌天地统治权后，重新制定了各界的法则，不仅毫不顾惜人类，同时也用强权压制其他派系的天神，水神共工本是炎帝派系大神，颛顼为削其权利，教唆火神祝融与之争斗，并暗中派兵相助。
共工得知此事，怒发冲天，约齐对颛顼不满的各路大神弑血为盟，组成联军，与颛顼派出的火神祝融展开了一场惊天动地的大战，两边的人马在各界间撕杀，神界、人界、昆仑，四神州，青丘之国……天上杀到凡间，又从凡间杀到天上，巨大的力量撞在了黄帝的封印上，在上面撞出了无数细小的裂缝。
祝融毕竟有颛顼帝在后相助，可以动用天地间无穷尽的力量，慢慢的共工的人马越杀越少，祝融的人马却越来越多，颛顼一声令下，人形虎尾的泰逢驾万道降光由和山杀至，龙头人身的计蒙狭狂风骤雨由光山杀来，型如巨蜂的骄虫率领毒虫毒蝎由平逢山浩浩荡荡扑向共工。
共工辗转杀到不周山下，身边只余一十三骑。颛顼派祝融前来劝降，共工大呼：“勿自由，宁愿死！”一头撞向不周山，将西北天柱不周山拦腰撞断，导致天地崩陷，洪水遍起，日向西落，水向东流，无数魔兽透过空间裂缝来到人间作乱，人类死伤无数。
大神女娲见民不聊生，斩巨鳌之脚撑天，又采五彩石以九天之火练成补天石五十一块，填补天地用去四十九块，剩下二石一块落在东圣神州傲来国花国山上，后来孵出了一只猴子，叫做孙悟空。另一块被女娲用天火玄气精练了九百年，练成了一枚宝珠名为天珠。
女娲有感于本应胜利的蚩尤，因为自己手下的九天玄女的插手落到分尸他处的下场，很是愧疚，就将天珠放于须睨山，用天珠的强大神力慢慢的帮助蚩尤修补灵魂，恢复力量，然后用滔天神力封住须睨山，自己和伏羲带领着盘古族利用盘古大神留下的遗物一同踏破虚空去寻找盘古大神的故乡，从此，除了叛逃到轩辕族的九天玄女，盘古族已经等同于不付存在了。
后来又过了无数年，颛顼的统治越发独裁了，炎帝与颛顼发生了矛盾，被颛顼削去神格，封印起来。炎帝的部将大神刑天不服，联合地界九黎族与颛顼争斗，于是就爆发了第三次的诸神大战。刑天右手持九天神器中的盾斧干戚，率领众神与颛顼大战于常阳山，可惜后来却被颛顼用内奸散布假情报引刑天入伏，数百大神围攻刑天，最后颛顼在一旁偷袭，一剑斩去刑天巨大的头颅。头颅滚到常阳山下仍怒发冲冠，大吼连连。众神以为刑天已经无力抵抗，顿时松了口气。却不料刑天不屈的意志爆发起来，以双乳为眼，脐为口，跳起连杀数人，闯出重围，逃入人界，从此不知去向。而九黎族的罗喉见独木难支，就带领九黎族退回九幽地界，再寻机会。
再后来，天帝颛顼被刑天不屈的精神所吓，怕刑天领军复来，于是就封印好了各界的通道，然后用封神印封闭了神界，再不管外面的事情。就这样过了无数年的，慢慢的人类就将天神的事情遗忘了。
慢慢的人类靠着遗留在凡间的残缺的修神典籍修炼到了一个不上不下，前所未有的境界，他们把这个境界叫做仙，而把那些异界来到人界的其他种族叫做妖。妖族强大而美丽，拥有着人类难以企及的财富和力量，不过好在他们的数量一向不多。人类是一个喜欢排外和推卸责任的种族，无论出了什么事情，总把责任推到妖的身上，说是妖们带来的，还有了非我族类，其心必异的话，开始冠冕堂皇的杀戮起妖，掠夺妖的财富。再强大的妖也抵挡不住成千上万的人类，倒在了人类的剑下。
慢慢的妖们就躲进了人迹罕至的深山老林，逐渐消失在人类的社会里，以往的一切逐渐成为了传说。而经过随着修神的失败，修仙的人越来越多，于是仙人们就把神界和人界中的一界叫做天界，定居在那里，于是就有了天宫，有了玉皇大帝，就有了现在的这个故事……
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